中医药系共有中医学、针灸推拿、中药学、中医养生保健四个专科专业，每年毕业生约400人，并联合华北理工大学开办中医学、针灸推拿、中药学三个本科专业，每年毕业生约160人。承担国家基层西学中能力建设工程，是河北省中药传统技能大赛基地，承办多次河北省药传统技能大赛。
师资队伍年龄、学历、职称结构合理，专业教师中“双师型”教师占比达到90%，在河北省和学校教学能力比赛中多人次获奖。近年来，中医药系教师主、参编《中医学》《中医常用诊疗技术实训与学习指导》《中医内科学学习指导》《中医护理学》等多部规划教材。在核心期刊发表学术论文多篇；承担省、市级科研课题13项，荣获市级科学技术三等奖以上奖励6项，拥有一支科研创新团队。
实验实训条件完善，建有设备齐全、功能完善的基础实验室以及实训室，教学设施配套齐全，现有经穴学及针刺仿真训练系统、网络版脉象训练仪等先进教学仪器设备，可满足日常实践教学的需要。近年来，各届学生在国赛和省赛中多次获奖。
中医药系拥有稳定的校外实习基地以及一支业务能力较强的基地兼职教师队伍。实习基地包括各类医院和大型药企，如沧州市中心医院、沧州市人民医院、沧州市中西医结合医院、国药乐仁堂等，可满足四个专业学生见习、实习需要。
中医药系秉承“依托行业、面向行业、融入行业”的产学合作教育思想，积极探索、建立“校院合作、工学结合”的产学结合教育模式，力争办出水平、办出特色，为卫生保健机构培养合格的高端技术技能型的中医药专业人才。
